يعد قسم علم الحيوان من الأقسام الرئيسية الرائدة في الكلية ، حيث تم تأسيسه مع إنشاء الكلية في عام 1975.
يهدف القسم إلى إعداد أجيال من العلماء والباحثين في مختلف مجالات علم الحيوان التي يتطلبها سوق العمل.
كما يلعب القسم دورا مهما وفعالا في تطوير المجتمع المدني في محافظة سوهاج من خلال تقديم الخدمات العلمية والتدريبية في العصر الأول للقسم ، تم تكريس الاهتمام لتدريس المقررات الأساسية ، بالإضافة إلى الدراسات التصنيفية للفقاريات واللافقاريات ، والتشريح المقارن ، وعلم الأجنة ، وعلم وظائف الأعضاء الحيوانية المقارن ، والبيئة ، وعلم الحشرات.
مع تطور علم الحيوان ، وتشعب فروعه ، واعتماده المتزايد على تخصصات أخرى مثل الفيزياء والكيمياء ، وابتكار التقنيات الحديثة ، والاتجاه نحو المعالجة البيئية ، تطور تدريس علوم الحيوان ليشمل دورات مثل علم الوراثة الخلوية ، والبيولوجيا الجزيئية ، وعلم الأجنة التجريبي ، وعلم الوراثة الجماعي ، وعلم المناعة ، وعلم الطفيليات ، والبيولوجيا البحرية والمائية. المياه العذبة والتنوع البيولوجي وغيرها من الفروع المتطورة لعلم الحيوان.
يقوم القسم بمراجعة الدورات بشكل دوري وإدراج الدورات الحديثة في دوراته ، خاصة لطلاب الدراسات العليا والدراسات الأولية للحصول على درجة الماجستير. بالإضافة إلى تدريس العلوم الأساسية لطلاب العلوم
يشارك القسم في تدريس مقررات علم الحيوان لطلبة كليتي التربية والزراعة. اهتم القسم – منذ إنشائه-بدراسة البحار وإجراء البحوث الرائدة في هذا المجال.
وقد فكر مسؤولو القسم ، جنبا إلى جنب مع إدارة الكلية ، في إنشاء محطة لبحوث المياه على البحر الأحمر ، بالقرب من مدينة القصير ، بعيدا عن التحضر والتلوث ، والعمل جار لإنشائها.
كما اهتم القسم بالدراسات في مجال المياه الداخلية والتي تضمنت دراسات مستفيضة في مجال بيولوجيا أسماك النيل واللافقاريات المائية وتأثير البيئة عليها.
يحرص قسم علم الحيوان على ترتيب رحلات ميدانية علمية لطلابه لزيارة إحدى المناطق البحرية لإجراء دراسات عملية للتعرف على الحياة البحرية ودراستها في بيئتها الطبيعية.